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Western Blot實驗過程中常遇到的問題
更新時間:2020-12-23   點擊次數(shù):1906次

Western Blot實驗過程中常遇到的問題

 

Western 免疫印跡(Western Blot)是將蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)移到膜上,然后利用抗體進行檢測。對已知表達蛋白,可用相應(yīng)抗體作為一抗進行檢測,對新基因的表達產(chǎn)物,可通過融合部分的抗體檢測。

WB 實驗中常會出現(xiàn)各種問題,迪申生物技術(shù)(上海)有限公司專注于生物試劑免疫組化相關(guān)產(chǎn)品多年,對 WB 實驗有一定了解,今天跟各位同學(xué)一起分享下 WB 實驗中各種問題及應(yīng)用對策。

 

電泳條帶成笑臉狀 膠不均勻冷切,中間冷卻不好,電泳系統(tǒng)溫度偏高 減少電壓減慢電泳速度,在冷室或者冰浴中進行電泳

電泳條帶成皺眉狀 可能是由于裝置不合適,特別可能是凝膠和玻璃擋板底部有氣泡,或者兩邊聚合不* 調(diào)整裝置

拖尾 樣品溶解不好 樣品充分溶解混勻后上樣

紋理(縱向條紋) 樣品中含有不溶性顆粒 樣品充分?jǐn)嚢杌靹?/p>

條帶偏斜 電極不平衡或者加樣位置偏斜 調(diào)整電極和加樣

條帶兩邊擴散 加樣量過多 適當(dāng)減少上樣量

Marker 變黑色 抗體和 Marker 蛋白反應(yīng) 在 Marker 和 sample 之間空出一個孔不上樣

背景高 膜封閉不夠 延長封閉時間,選擇適宜的抗體稀釋度

一抗稀釋度不適宜 對抗體進行滴度測試,選擇適宜的抗體稀釋度

一抗孵育的溫度偏高 建議 4℃ 結(jié)合過夜

二抗?jié)舛榷冗^高 降低二抗?jié)舛?/p>

二抗的非特異性背景 增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗(特異性更強的,只針對重鏈)

二抗孵育時間過久 減少二抗孵育時間

選擇膜的問題 硝酸纖維素的背景會比 PVDF 膜低

膜在實驗過程中干過 實驗過程中要注意保持膜的濕潤

檢測時曝光時間過長 注意曝光時間的縮短

洗膜不充分 增加洗膜的時間和次數(shù)

抗體和封閉蛋白有交叉反應(yīng) 檢測抗體與封閉蛋白的交叉反應(yīng)性,選擇無交叉反應(yīng)的封閉劑。洗滌液中加入 Tween-20 可減少交叉反應(yīng)

雜帶較多 目的蛋白有多個修飾位點(化位點,糖基化位點,乙酰化位點等),本身可以呈現(xiàn)多條帶 查閱文獻或進行生物信息學(xué)分析,獲得蛋白序列的修飾位點信息,通過去修飾確定蛋白試劑大小

目的蛋白有其他剪切本 查閱文獻或生物信息學(xué)分析可能性

樣品處理過程中目的蛋白發(fā)生降解 裂解液中加入蛋白酶抑制劑,樣品處理在冰上進行

上樣量過高,太敏感 適當(dāng)減少上樣量

一抗不純 純化抗體

一抗特異性不高 重新選擇或制備高特異性的抗體

二抗的非特異性結(jié)合 增加一個二抗對照,不加一抗,其他操作過程不變,即可驗證背景是否是由于二抗所致。可選擇其它二抗(特異性更強的,只針對重鏈)

一抗或二抗?jié)舛绕?降低抗體濃度

細胞傳代較多,導(dǎo)致蛋白變異 使用原代或傳代少的細胞作對照

蛋白條帶位置

(大小)不對 二聚體或多聚體存在 增加蛋白質(zhì)變性過程及強度

翻譯后剪切 比如很多蛋白是以前體蛋白的形式合成的,在執(zhí)行功能時需要進行剪切成活化的形式

相對電荷 氨基酸電荷的組成

蛋白修飾 比如糖基化、化等修飾狀態(tài)會導(dǎo)致蛋白分子量增加

膠濃度 不同濃度的膠跑出的蛋白條帶的位置可能有所偏差

無蛋白條帶 抗體孵育不充分 增加抗體濃度,延長孵育時間

酶失活 直接將酶和底物進行混合,如果不顯色則說明酶失活了。選擇在有效期內(nèi)、有活性的酶聯(lián)物

標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低 設(shè)置陽性對照,如果陽性對照有結(jié)果,但標(biāo)本沒有則可能是標(biāo)本中不含靶蛋白或靶蛋白含量太低。可考慮增加標(biāo)本上樣量解決靶蛋白含量低的原因

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